医院核定床位600张，开设临床科室29个，医技科室9个，其中消化内科、产科、心内科、神经外科、普外科、泌尿外科、肾内科、医学影像科和风湿免疫科9个科室为国家临床重点专科。仁济南院全面开放门诊、急诊、病房和ICU,为区域百姓提供全方位的医疗服务。配置CT、MR、DSA、SPECT、DR、钼靶、数字胃肠机和血液净化机等大型设备，同时配备可容纳20座的大型高压氧舱，设备配置水平达到三级综合性医院的标准。

医院始终将提升医疗质量、保障医疗安全放在首位，实施与仁济母体医院医疗质量同质化管理。母体医院重点学科和重点专科全部落户南院。南院科主任均由母体医院科主任、学科带头人兼任，南院执行主任均由母体医院科副主任兼任。依托母体医院重点学科扶持，南院大力推进临床特色专科建设，并通过有效整合南院医疗资源，优化学科布局，以形成与母体医院适度错位发展、适应周边地区居民就医需求的亚专业格局为发展方向。医院始终以患者为中心，积极搭建临床学科创新共建平台，建立符合诊疗规范的MDT管理模式。通过以国家卫计委临床重点专科领衔多学科诊疗模式建设，对传统围绕肿瘤疾病的多学科诊疗模式进行了新的拓展，充分发挥综合性医院特长，以疾病为纽带，成立了自身免疫疾病、脑卒中、脑肿瘤、盆底疾病4个MDT诊疗中心，推动多个学科临床、科研、教学的全面深入发展，提升多种疑难疾病的诊治水平，并深化相关临床研究，组建一支高效互补的临床团队。

医院将人才培育与梯队建设作为重点工作。通过落实“科执行主任出国访问交流计划”“骨干出国访学进修计划”等人才培养计划，选送优秀学科带头人、学术业务骨干分别至国际一流学术机构开展交流访问，促进优秀中青年学科带头人和临床骨干的成长。同时，设立“学科建设和人才培养专项经费”并细化实施细则，逐年持续加大投入力度。以优化学科错位布局、促进多学科一体化发展为重点，以培养国际化优秀医学骨干、构建合理人才梯队结构为目标，大力推进学科人才建设。

教学方面，南院依托仁济母体医院教学管理优势，以教学基地建设为契机，逐步开展教学工作。顺利通过上海市住院医师规范化培训教学基地评估，设立内科、外科、妇产科、儿科、急诊科、医学影像科、全科医学科等规培教学基地11个。医院积极建设具有国际影响力的实训中心，Walter E. Dandy神经外科学会亚洲唯一的手术培训中心和北美医学教育基金会尿失禁及盆底手术培训中心先后落户南院.

在坚持公立医院公益性方面，仁济医院南院勇于成为“试点中的试点”，于2012年2月起启动“仁济关爱日”系列公益活动，组织广大医务人员下社区、下学校、下村镇进行健康教育及各类咨询义诊活动，在和谐社会中开创独具公立医院特色的和谐医患关系，使政府办医的社会效益大增。作为医改试点的排头兵，医院落实管办分开，探索建立法人治理结构，建立公立医院管理新机制；全面实施“医药分开”改革试点，建立公立医院补偿新机制，推进内部运行机制转变；技术引领，服务基层，积极探索“1+1+1”分级诊疗工作。医院认真总结医改试点实践经验，改革成果通过各类现场调研、院际交流、行业内交流等面向全国推广.

南院的建立与发展获益于上海市政府深化医药卫生体制改革，调整医疗资源，提高郊区居民享受优质医疗服务可及性的重大战略决策，也受益于母体医院的倾力支持。南院将进一步改革创新，主动适应经济社会发展新常态，逐步形成以公益性为核心的公立医院发展模式，努力开创大型公立医院改革新局面。